数量性状遗产分析

目录前言第1章数量性状遗传研究基础11.1遗传学基础及其发展21.1.1质量性状遗传与经典遗传学的发展21.1.2数量性状遗传与数量遗传学的发展61.1.目录前言第1章数量性状遗传研究基础11.1遗传学基础及其发展21.1.1质量性状遗传与经典遗传学的发展21.1.2数量性状遗传与数量遗传学的发展61.1.3DNA标记与现代数量遗传学141.1.4数量遗传学在我国的发展141.2群体遗传学基础及其发展151.2.1孟德尔群体遗传结构的数学模型151.2.2随机交配下理想大孟德尔群体的平衡171.2.3群体在非随机交配下的遗传效应191.2.4改变群体基因频率的因素291.3统计学基础311.3.1正态分布及其参数估计321.3.2有限混合正态分布及其参数估计351.3.3线性统计模型基础40第2章近交与随机交配群体的遗传分析542.1基因型与环境542.1.1表现型值与基因型值542.1.2基因型与环境互作的方差分析552.2基因型值分解、基因的平均效应和育种值562.2.1基因型值的分解562.2.2平衡群体中基因的效应582.2.3平衡群体中个体的育种值和育种效应602.2.4育种值和基因型值的关系602.3近交群体数量性状的世代均数分析622.3.1世代平均数的遗传组成(期望组分)622.3.2遗传参数估计与遗传模型检验652.4近交群体数量性状的世代方差分析752.4.1不分离世代的方差752.4.2分离世代集团混种(混养)的方差剖分762.4.3F1代连续自交的分支交配系统方差的逐级分解772.4.4S3、S4世代方差的分解812.4.5显性度832.4.6自交选择的*适世代及分离极限估计852.5连锁对世代均数和方差的影响862.5.1加性-显性遗传模型下的两对与多对基因连锁的F2代遗传分析862.5.2连锁对F1代连续自交的分支交配系统方差的影响902.5.3连锁不平衡群体922.6随机交配群体中亲属间的相关与回归932.6.1随机交配平衡群体中亲属遗传协方差及其相似性932.6.2近亲交配群体的近交系数计算1012.6.3亲属协方差的一般形式1052.6.4常见亲属协方差组分中u和r的计算106第3章重复力、遗传力、相关及其估计1093.1重复力、遗传力和相关的概念1093.1.1遗传力(率)和重复力(率)1093.1.2表型相关、遗传相关和环境相关1113.1.3亲属间的表型相似性1133.2重复力、广义遗传力估计及重复力的应用1133.2.1单因素遗传设计试验的组内相关估计方法1143.2.2重复力的准确度及其应用1203.3狭义遗传力的估计1233.3.1用双亲本杂交类型遗传设计估计遗传力1233.3.2用NCI遗传设计试验估计狭义遗传力1273.3.3用NCII遗传设计试验估计狭义遗传力1413.3.4用NCIII遗传设计估计狭义遗传力1453.4多个数量性状的遗传力和相关估计1483.4.1单因素遗传设计完全随机区组试验估计方法1483.4.2NCI遗传设计完全随机试验的多性状遗传力和相关估计1553.5阈性状及其重复力、遗传力的估计1643.5.1阈性状的重复力估计1653.5.2阈性状的遗传力估计1693.6遗传力、重复力显著性测验原理1753.6.1均方的方差估计1753.6.2均方比的方差估计1753.6.3常用遗传设计试验中组内相关系数的假设检验176第4章选择原理、方法和模型1834.1选择的基本原理1834.1.1选择及其预期选择反应1844.1.2选择极限与世代选择效率指数1874.1.3世代间隔、单位时间遗传进展与现实遗传力1904.2单性状选择方法1924.2.1个体选择1924.2.2家系选择与同胞选择1934.2.3家系内选择1944.2.4合并选择1954.2.5几种选择方法相对效率比较1964.3间接选择和综合选择指数1994.3.1间接选择1994.3.2多性状的选择-综合选择指数2014.3.3选择指数的通径分析和决策分析2054.3.4相关遗传进展分解原理与决定系数遗传力2074.4通用选择指数2114.4.1通用选择指数2124.4.2通用选择指数的通径分析和决策分析2184.5组合性状与组合性状对分析2194.5.1约束组合性状分析2194.5.2约束组合性状对分析及其通径分析、决策分析234第5章主基因-多基因遗传体系分析2435.1单个分离世代数量性状的分离分析2445.1.1单个分离世代表型分布的主要特征2445.1.2F2代数量性状分离分析模型2455.1.3回交世代的主基因-多基因混合遗传分离分析模型2515.1.4单个分离世代数量性状分离分析的一步法和两步法2575.2数量性状的多世代联合分离分析简介2635.3主基因-多基因数量性状的综合选择指数2725.3.1综合选择指数原理2735.3.2应用举例273第6章交配效应与配合力分析2786.1交配效应分析2786.1.1近交衰退2786.1.2近交导致的群体遗传方差再分配2836.1.3杂种优势2886.1.4杂交引起的群体遗传方差再分配2936.1.5近交、杂交与环境方差2986.1.6杂种优势的机理3006.2配合力分析3026.2.1配合力概念及其方差3036.2.2配合力估计的试验设计方法3056.2.3双列杂交完全随机区组试验的配合力分析3066.2.4关于多元双列杂交的配合力分析351第7章数量性状与分子遗传学3587.1数量性状与遗传学3587.1.1数量性状与经典遗传学3587.1.2数量性状与分子遗传学3607.1.3遗传标记与基因定位3627.2QTL的初级定位及其作图原理3657.2.1作图群体的建立3667.2.2图谱构建的理论基础3677.3单标记分析法3757.3.1单标计分析样本资料表3757.3.2用重组率r表示的标记和QTL基因型频率表3757.3.3基于标记分组的标记和QTL的共分离信息3767.3.4均值差-方差分析法及参数估计3797.3.5**似然估计的EM算法3847.4区间作图法和复合区间作图法3887.4.1区间作图法3887.4.2复合区间作图法3927.5数量性状的标记辅助选择3967.5.1标记值选择3967.5.2指数选择3977.5.3数量性状的分子标记辅助选择3997.6KEGG通路的通径分析及其决策分析4027.6.1DIA方法的KEGG通路4027.6.2KEGG通路DIA影响的通径分析及其决策分析4077.6.3细胞过程路梯度分析、通径分析及其决策分析4087.6.4梯度分析、通径分析及其决策分析与DIA方法的比较418参考文献420