本书续《剑网尘丝》未完的故事。穆娟娟为获得心上人齐勒铭的爱，能够终生相守，不惜捏碎了齐勒铭的琵琶骨，使之武功全废，不料武当五老及华山派门人先后前来寻仇，齐勒铭顿时陷入绝境中。幸得上官飞凤出手救助，澄清了事实，并愿助齐勒铭恢复武功。穆娟娟对上官飞凤充满感激。
飞天神龙卫天元为报杀父之仇，冒着被清廷抓住的危险，公开向徐中岳挑战。秘魔崖下，各方当事人对质，揭穿徐中岳和假剪大先生的面目，原来假剪大先生乃是白驼山主的师兄慕容垂。这时御林军统领穆志遥安排高手围捕卫天元，上官飞凤现身，以本门“幻剑灵旗”的令符驱散大内高手。一番激战，慕容垂、徐中岳被卫天元、姜雪君所杀，但卫天元身受重伤，姜雪君也中毒身亡。
卫天元因姜雪君之死痛不欲生，幸得上官飞凤相救并设计开解，使他有了求生的欲望。卫天元伤愈后与上官飞凤并骑南下，前往扬州拜祭姜雪君，途中两人感情也与日俱增。原来上官飞凤深爱卫天元，但她知道卫天元的师妹齐漱玉也深爱卫天元，而卫天元爱的却是姜雪君。于是上官飞凤设下计谋，双管齐下，一方面趁楚天舒与齐漱玉双双中毒之机，将二人救出，安排在一起，让齐、楚二人相互帮助从而日久生情；另一方面又以帮助姜雪君报仇为代价，设计安排姜雪君诈死，以绝卫天元之念。终于卫天元向上官飞凤求婚，上官飞凤喜出望外，但内心也感到隐忧。
不料穆好好及穆娟娟姐妹的姑姑，白驼山主宇文雷的旧情人穆欣欣与徐中岳之妻赵红眉之姊赵青眉，假扮上官飞凤与穆娟娟到齐燕然家中偷袭，打死了齐燕然亲如手足的忠仆丁勃，并嫁祸上官飞凤。致使齐燕然一气之下赶到昆仑山星宿海，要与上官飞凤之父上官云龙决斗为丁勃报仇。双方一场生死决战两败俱伤，幸好卫天元和上官飞凤及时赶到才避免了同归于尽。原来这一切全是出于宇文雷的安排，宇文雷同时鼓动上官云龙的副手盖覆天及西域十三家门派群起作乱，趁机前来夺取灵旗，意图改奉白驼山为宗主，形势万分危急，好在得上官飞凤之助恢复了武功的齐勒铭和穆娟娟及时赶到，挫败了盖覆天等人的阴谋。
上官飞凤、卫天元和楚天舒先后前往白驼山，在齐勒铭的暗助下终于打败了宇文雷。宇文雷与其妻穆好好及旧情人穆欣欣之间数十年的感情纠缠，相互积怨而终于中毒死在密室中。姜雪君出家为尼，谢绝了卫天元的爱意。卫天元若有所悟，终于全心全意接纳了深爱着他的上官飞凤，楚天舒和齐漱玉也成就了美满姻缘。
回花落水流几番离合
丝连藕断难说恩仇
第二回 怨气易消芳心难测
武功虽失侠骨犹存
第三回 欺世盗名假真莫辨
舍身毙敌玉石俱焚一
第四回 境换情移空怀旧侣
心亡物在相对无言
第五回 谣诼纷纭问谁能解
世途艰险 岂得无愁
第六回 好戏连场灵堂混战
玲珑布局妙手解危
第七回 纷乱残棋难防情变
氤氲迷雾另有病因
第八回 追究祸因变生肘腋
难开心锁泪湿罗衣
第九回 误会重重双雄决斗
危机处处外祸齐来
第十回 力歼奸徒冰台决斗
惊闻叛乱大漠驰援
第十一回 劫后重逢现身幽谷
孽由自作曳尾泥涂
第十二回 解脱尘丝仗他幻剑
擘开世网‘奉我灵旗
