作为“科学人文读本之一”，《通透的思考》于2006年初版（主要鉴于《清澈的理性》《蔚蓝的思维》两年前出版引起了市场的好评，读者来信要求增补一些文稿，内容再丰富一点，我们就重启炉灶，再平行地选编了《通透的思考》《金色的想象》），首印的5000册很快售罄，当年就重印了。在获得上海科普图书出版专项基金后，2012年作了部分选文调整，又出了第二版。更令人欣慰的是本书与《金色的想象》还取得了不俗的社会效益，相继荣获2007上海书市 “我最喜爱的图书”（20本之一），2014年被上海市委宣传部、市科委、教委、科协、新闻出版局及上海市网民评为“上海市民喜爱的10部科普图书”之一。《通透的思考》现分成三大部分，分别为：科学人文（选文23篇）、科学艺术（选文11篇）、科学情怀（选文17篇），共51篇有见地的美文。
科学人文
爱因斯坦 为制造原子弹给罗斯福总统的信
爱因斯坦 为制造原子弹问题给日本《改造》杂志的声明
张桂华 在国家利益之上
爱因斯坦 宗教同科学不可和解吗？
季羡林 天人合一文理互补
一位北大学生 请为我的父母祈祷
费孝通 文化论中人与自然关系的再认识
波普尔 科学进步的障碍
杨振宁 《易经》对中华文化的影响
胡适 科学的人生观
宗白华 近代技术的精神价值
詹克明 实事求“不”
林群 创新离不开积累和文化
钱定平 哈佛的“化学谈禅”
查建英 垃圾与丰胸
詹克明 保护“诺亚方舟”
从维熙 自然悟语
王梓坤 贵在一个“新”字
——略谈独立思考
阿·布奇沃德 新鲜空气会要你的命
彭瑞高 不要理睬身上没毛的东西
侯笑如 仰望天空的承诺
鹿子 愿地球最后一滴水不是眼泪
沈孝辉 生态旅游，我们准备好了吗？
科学艺术
沈致远 科学是美丽的
朱光潜 “慢慢走，欣赏啊!”
——人生的艺术化(节选)
赵鑫珊 爱因斯坦与艺术
丘成桐 数学与中国文学的比较
宗白华 谈技术美学
方正怡 科学与艺术的会合
——李政道的艺术情
邵丹 毁灭的美
秦伯益 从这里开始
王振东 微风动柳生水波
——韦应物诗中的力学现象
王庚 埃舍尔作品的数学趣味
方鸿辉 人生几何学几何
——谷超豪的诗性数学人生
科学情怀
爱因斯坦 科学的共同语言
艾伯特·戈尔 《寂静的春天》前言
詹克明 让每一块石头卓立起来
史蒂芬·霍金 公众的科学观
德迪韦 科学家的素养
杨振宁 我的学习与研究经历
杨福家 哥本哈根精神
雷切尔·卡森 赋予世间的儿童以新奇感
邵燕祥 人啊，人
詹克明 瓦尔登湖——大地的眼睛
李政道 我和CUSPEA
莱德曼 寻找自我
林语堂 乐园失掉了吗？
饶毅 中国的未来与科学的隐患
唐小为 打着游戏学科学
——美国大学的虚拟实验课
罗·马·弗里德曼 中国人无须对诺贝尔奖孜孜以求
