《高等学校"十二五"规划教材·市政与环境工程系列研究生教材:生态与环境基因组学》介绍了一个非常前沿的领域——生态与环境基因组学。这门学科将基因组学的研究手段和方法引入到环境生态学领域。《高等学校"十二五"规划教材·市政与环境工程系列研究生教材:生态与环境基因组学》结合生态环境的宏观研究与基因组学的微观研究，全面讨论了环境与生态基因组学的各个专题，包括研究进展、研究方法与手段、主要涉及技术、生态环境中的生物作用及作用机制以及未来面对的挑战和发展前景。《高等学校"十二五"规划教材·市政与环境工程系列研究生教材:生态与环境基因组学》涉及的领域包括生态学知识、环境工程知识、基因组学知识、分子生物学知识和微生物学知识等。《高等学校"十二五"规划教材·市政与环境工程系列研究生教材:生态与环境基因组学》虽然是对一门交叉学科的研究，但却力争做到前沿性和系统性相统一。

第1章基因组学
　1.1基因组学的定义
　1.2基因组学的分类
　1.3基因组学研究现状
　1.4研究功能基因组学的挑战
　1.5我国基因组学研究进展
第2章生态与环境基因组学
　2.1生态与环境基因组学的含义
　2.2生态与环境基因组学的研究对象
　2.3生态与环境基因组学研究的主要项目
　2.4生态与环境基因组学研究的意义
第3章模式生物基因组学
　3.1模式生物的定义
　3.2模式生物基因组研究进展
　3.3模式生物的基因工程 第1章基因组学
　1.1基因组学的定义
　1.2基因组学的分类
　1.3基因组学研究现状
　1.4研究功能基因组学的挑战
　1.5我国基因组学研究进展
第2章生态与环境基因组学
　2.1生态与环境基因组学的含义
　2.2生态与环境基因组学的研究对象
　2.3生态与环境基因组学研究的主要项目
　2.4生态与环境基因组学研究的意义
第3章模式生物基因组学
　3.1模式生物的定义
　3.2模式生物基因组研究进展
　3.3模式生物的基因工程
第4章水体基因组学——海洋环境生态基因组学
　4.1水体的概念
　4.2水体污染治理方法与现状
　4.3宏基因组学研究方法进展
第5章土壤基因组学
　5.1土壤宏基因组文库
　5.2土壤宏基因组文库的筛选技术
　5.3宏基因组测序及数据分析
　5.4基于宏基因组的微生物生态学与环境学分析
　5.5宏基因组学在土壤微生物生态学中的应用与展望
第6章环境中的病原微生物基因组学
　6.1通过基因组测序和功能注释研究细菌致病机理
　6.2利用比较基因组学研究细菌致病性
第7章生态与环境基因组学研究方法
　7.1基因芯片
　7.2DNA微阵列的原理与应用
　7.3荧光原位杂交技术
　7.4基因差异表达研究技术
第8章生态环境中的微生物群落功能基因与表达分析
　8.1环境微生物群落功能基因与定位
　8.2环境微生物群落功能基因表达分析
第9章生态环境中的抗逆、抗病基因
　9.1植物在生态环境中的抗逆机制
　9.2生态环境中的植物抗逆基因工程研究进展
　9.3植物抗逆相关基因的分离
　9.4植物在生态环境中的抗病研究
　9.5植物抗病基因工程的原理
第10章生态环境中的毒理基因组学
　10.1生态环境中毒理基因组学的产生
　10.2毒理基因组学的特点
　10.3生态与环境中的毒理基因组学技术支持
　10.4毒理基因组学的生物平台
　10.5毒理基因组学的应用
　10.6毒理基因组学在生态风险评价方面的应用
　10.7毒理基因组学目前尚待解决的问题
　10.8MicroRNA毒理基因组学的优势和挑战
　10.9结论与展望
第11章基因组学在生态环境中的催化和降解作用
　11.1生物降解
　11.2生物催化
　11.3生物催化和生物降解的信息学
　11.4总结
第12章基因组学在环境中对抗菌药物的发现及影响
　12.1抗生素药物筛选简介
　12.2抗生素药物发现的历史进程
　12.3新药物开发所遇到的挑战
　12.4微生物基因组学和药物靶点的筛选
　12.5确定治疗用途：药物靶点筛选和验证
　12.6基因组学和毒理学：毒物基因组学的产生
　12.7总结
第13章基因组学与酶的发现和疫苗开发
　13.1酶的发现
　13.2疫苗的开发
第14章生态与